La temporada ha resultado más complicada. Contrario a lo que se esperaba, Gustavo Ayón ha tenido pocos minutos con el Magic de Orlando. Al inicio, durante la Pretemporada, el mexicano tenía plena confianza en que durante 2012-13 se consolidaría con su nueva franquicia.
Su estupendo paso por los Hornets de Nueva Orleans hacía presupuestar eso; sin embargo, las cosas han sido distintas, en parte, a una lesión que sufrió en el pulgar de la mano izquierda, que lo dejó fuera en la parte final de la Pretemporada. En los primeros cuatro meses de juego, Gustavo ha visto acción en 40 partidos de los 51 de Orlando, promediando 13.6 minutos, 3.4 rebotes, 1.4 asistencias 0.3 robos, 0.3 bloqueos y 3.6 puntos, cifras que sin duda resultan ser bajas para un jugador que busca la titularidad.